【作者】張蕊 楊樹德 程顯好 包海鷹 圖力古爾
【機構(gòu)】山東省食用菌技術(shù)重點實驗室魯東大學菌物科學與技術(shù)研究院吉林農(nóng)業(yè)大學菌物研究所
【摘要】研究鵝膏毒肽與RNA聚合酶Ⅱ相互作用的分子機制,利用分子對接方法獲得了9種鵝膏毒肽與RNA聚合酶Ⅱ相互作用的結(jié)合模式、結(jié)合位點、對接能和抑制常數(shù)等信息,并對鵝膏毒肽的毒性與結(jié)構(gòu)間的構(gòu)效關(guān)系進行了考察。結(jié)果表明:利用分子對接方法獲得的鵝膏毒肽與RNA聚合酶Ⅱ相互作用的信息與實驗結(jié)果相一致;不同R2取代基引起毒素與聚合酶II結(jié)合能力強弱不同,從而導致鵝膏毒肽分子間的毒性差異。結(jié)果證實了運用分子對接方法探索多肽分子與蛋白質(zhì)相互作用的可行性,為在分子水平上研究多肽與蛋白質(zhì)的相互作用開拓了新的思路。
【基金】國家自然科學基金(No.31200048); “泰山學者”建設(shè)專項基金; 山東省優(yōu)秀中青年科學家獎勵基金(No.BS2011SW002); 魯東大學人才引進基金(No.LY2011017);
【關(guān)鍵詞】鵝膏菌; 鵝膏毒肽; RNA聚合酶Ⅱ; 分子對接;