香菇重組交換在基因組中的分布特征

易菇網訊  12月15日，華中農業(yè)大學植物科學技術學院邊銀丙教授領銜的應用真菌研究團隊聯(lián)合中國農業(yè)科學院麻類研究所在Journal of fungi（2020IF=5.816）上在線發(fā)表了題為“Chromosome-wide characterization of intragenic crossover in shiitake mushroom, Lentinula edodes”的研究論文，龔文兵副研究員為論文第一作者，肖揚副教授為通訊作者。該研究首次表征了香菇重組交換特征及其熱點分布，并對香菇重組交換變異進行了遺傳解析。

重組交換（crossovers，COs）是減數(shù)分裂的核心事件，亦是基因組進化和遺傳多樣性形成的關鍵驅動力之一，是育種的基礎。通過遺傳作圖研究重組交換，分析COs在基因組中的分布，了解重組熱點形成機制，挖掘調控重組變異的遺傳位點，有助于開發(fā)有效方法調控重組發(fā)生，打破育種的瓶頸。本研究利用香菇 F1 單核體群體的基因型數(shù)據(jù)，在全基因組水平對香菇的重組交換進行了表征，鑒定了884個COs，主要聚集于65個COs熱點區(qū)域，并分析了熱點區(qū)域的富集基序。隨后利用連鎖分析鑒定了調控不同類型重組交換變異的遺傳位點及候選基因，該結果有利于加深對大型真菌同源重組保守型與多樣性機制的認識水平。

該成果是團隊在香菇遺傳學研究領域取得的又一重要進展。今年3月和9月，團隊先后在Journal of Advanced Research (2020IF=10.479) ，Computational and Structural Biotechnology Journal (2020IF=7.271) 發(fā)表重要研究論文。相關研究獲得了國家自然科學基金、國家重點研發(fā)計劃和華中農業(yè)大學自主科技創(chuàng)新基金等項目的資助。

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